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クジラやイルカなど鯨類は陸に起源を持つ海棲哺乳類で、およそ5000万年の時を経て、地球上のあらゆる水域に広く適応してきました。鯨類学研究室では、鯨類の生物学や生態学的な研究を通じ、鯨類の進化、生態、資源などを明らかにしていきます。フィールド調査によって得られたサンプルを用いての進化系統分類・資源生物学的研究や、外部機関が実施している調査で得られた南極海と北太平洋のデータを借用し研究しての生態学的研究などを行っています。外部機関が実施する目視調査に参加する機会もあります。
これらの研究成果に基づき、人間と鯨類、さらには海洋環境を含めた相互関係を探求することを目標にしており、野外においてできる限り鯨類とその海洋環境に触れながら標本やデータを採集し、それらを用いた鯨類学の研究に取り組んでいます。